Kétértelműség stop kodon
Nyelvek az emberek nem egyértelműek, sok a szavakat, hogy nem egy, hanem több jelentése van. Általában elkapjuk a jelentését a szövegkörnyezetből, amit mondott. A sejteket a saját nyelv, amelyet használni a fehérje szintézisben. Ez a genetikai kód, amely a 64 nukleotid tripletek (kodonok), 61 amelyek közül értelmes kódolni bizonyos aminosavak és három stop-kódon okozhat megszűnése fehérjeszintézis-molekula (broadcast). De kodon kiderül, lehet, hogy más a jelentése, és megérteni, mi van, ismét összpontosítani összefüggésben.
Mintegy invarianciájának a genetikai kód van írva a tankönyvekben, de a szakértők tudják, hogy ez nem az. Az első alkalommal a félreérthetőség talált 1985-ben csillósok, majd a zöld algák és diplomonad, valamint a mitokondriális genomban. Ezekben az esetekben, stop kodonok nem csak megszűnését fehérjeszintézis, hanem kódolni azt bármely aminosav. És hogyan, kérem, riboszóma megkülönböztetni azokat az eseteket, amelyekben a kodon kell olvasni, és amelyben - foglalkozni vele? A válasz erre a kérdésre keresi a szakemberek Bern és a University of Pisa irányítása alatt Berne professzor Mariusha Novatski (Mariusz Nowacki).
A kutatók elemezték kiterjedt transzkriptom adatbázis (beállítva az összes RNS-molekulák) tengeri egysejtű eukarióták (Marine Mikrobiális eukarióta Transzkriptom Sequencing Project, MMETSP), kimutatására és osztályozza újraosztani kodonokat. Áthelyezett három megállító kodonok kerülnek genomjában található több faj csillósok: az UAA és az UAG kódolni glutamin, cisztein vagy tirozin, és UGA - triptofán. Minden szemantikai kodon tRNS felel ház, így egy adott aminosav, és egy stop-kodonok lépnek kölcsönhatásba specifikus proteinek - transzlációs terminációs faktorok. Így, az egyes kodonok versenyeznek áthelyezett legalább egy tRNS, és transzlációs terminációs faktorok eRF1.
A legtöbb vizsgált faj csillósok együtt újra felvételezni stop kodonokat maradt legalább egy invariáns, de Condylostoma Magnum és Parduzcia sp. leképezve három: MHT és UAG kódolni glutamin, UGA - triptofán. Ez a két típusú kutatók és folytatta a munkát. A tanulmány kezdődött egy sorozat hiszton H4 - az egyik legkonzervatívabb. Ez általában végződik a stop kodon UAG vagy UGA. Kísérletek azt mutatták, hogy a riboszóma kihagyja ezt a helyzetet rendkívül ritka, frekvenciája 1,8% -nál kisebb, általában ezen a ponton a felmondás. Azonban azokban az esetekben, ahol stopkodon közepén a kódoló szekvencia, a riboszóma érzékeli azokat értelmes. A tudósok találtak egy tRNS, amely felismeri az UAA és UAG. Idő előtti megszüntetését fordítás ugyanakkor nem fordul elő.
Hogyan lehet megkülönböztetni a jelentését a kétértelmű kodon? Kutatók javasolt két hipotézist: vagy mellett a kodonok specifikus szekvenciákat, amelyek lehetővé teszik tRNS vagy eRF1 a helyes választás, illetve az érték a kodon határozza meg pozícióját az RNS molekula. Ha egy stopkodont végén található a molekula, szabályozó fehérjék érzékelik, mint egy stop jelet. Alkalmas szekvencia markerek, értékének meghatározása a kodon, a tudósok nem találtak, így középpontjában a második hipotézis.
MRNS-molekulákat, amelyek olvasni a riboszóma protein molekulák jellegzetes struktúrája. A kódoló szekvencia végén egy stopkodon, majd egy rövid 3'-végi nemkódoló régió és néhány adenin maradékok - poli (A) farok (lásd az ábrát.). 3'-nem-kódoló régió lehet olyan rövid, hogy a poli (A) farok néha gyakorlatilag ellen a stop kodon, ezért a tudósok úgy vélik, hogy ez a stopkodon képest a poli (A) farok, hogy meghatározza annak értékét. Ha a farok nagyon közel van, meg kell tenni a „pont”; stop kodonokat található távolabb a poli (A), az utolsó 24-66 nukleotidját kodon, értelmezni,.
Ha semmi értelme kodon egy bizonyos helyzetben gyakran olvasni a „stop”, a kiválasztás eltávolítja onnan, mert a hiba túl sokba. Ha a feltételezést, hogy az érték a stop kodon függ viszonyított helyzete a 3 „végén a molekula, helyes, ezek a hibák ne lépjen fel leggyakrabban azokban az esetekben, amikor a szemantikai stop kodon nem található a végén a molekula, de a közelében, és vezet az idő előtti megszűnése. Ebben az esetben az evolúció során, akkor el kell tűnnie. És valóban, a végén az mRNS kódoló régió, mielőtt a tényleges stop kodon, jelentése nem testvérek. Bármely más kodonok, például összesen hatásokat figyeltek.
Tehát Mariush Nowacki és kollégái olyan modellt javasolt, amelyben stopkodon mRNS-molekulák csillósok C. magnum és Parduczia sp. Az alapértelmezett értelmezni, ahelyett, hogy szolgáljon egy stoptábla. Transzlációs terminációs akkor történik, amikor a stopkodon pedig a végén található a molekula. A kutatók arra a következtetésre jutott, hogy a működése kodon stop-jel befolyásolja a közelsége a poli (A) farok és fehérjék, amelyek kölcsönhatásba lépnek vele. Különleges szerepet rendelni fehérje PABP.
Mivel stopkodonjai elosztott teljes hosszában a gén, és a broadcast biztonságosan, ez nem egy mutáció, és megváltoztatni a genetikai kódot. Feltűnő, hogy az ilyen változások történtek csak csillósok, más eukarióta faj a 265 MMETSP nem azok.